Уверен, в адрес RSS-канала можно запихнуть идентификатор пользователя, чтобы при прочтении новостей через сторонний RSS-агрегатор на сайте сохранялась инфа о том, что пользователь уже прочитал новости и при входе на сайт эти прочтенные новости не отображались в списке непрочтенных. Или вы настолько глубоко в коде не ковыряетесь?